Triofox beheert automatisch de versiebeheer van bestanden, waarbij elke keer dat een bestand wordt weggeschreven een nieuwe revisie wordt gemaakt. Voor bewerkingsconflicten maakt het gebruik van bestandsvergrendeling, waarbij de eerste gebruiker die een bestand opent het vergrendelt voor bewerking, en latere gebruikers alleen een alleen-lezen kopie kunnen openen totdat het bestand ontgrendeld is.