Triofox utilizza una funzione di blocco dei file che funziona sia internamente che esternamente per gestire efficacemente i conflitti di sincronizzazione dei file. Quando un utente apre un file, questo viene bloccato, impedendo ad altri di sovrascrivere le modifiche. Gli utenti che tentano di accedere allo stesso file riceveranno un messaggio che indica che il file è in uso, con l'opzione di accedere a una copia in sola lettura.